ปี พ.ศ. 2519 กรมศุลกากรจึงได้ก่อสร้างอาคารที่ทำการด่านศุลกากรภูเก็ตแห่งใหม่ เป็นตึก 2 ชั้น ชั้นล่างเป็นที่ทำการด่านศุลกากรภูเก็ต ชั้นบนเป็นที่ทำการของสำนักงานศุลกากรภาคที่ 5 (ต่อมาได้ยกเลิกสำนักงานศุลกากรภาคที่ 5) และปัจจุบันกรมศุลกากรได้ดำเนินการจัดตั้งที่ทำการสำนักงานศุลกากรภาคที่ 5 อีกครั้ง โดยมีด่านฯ ในความรับผิดชอบ ดังนี้ ด่านศุลกากรภูเก็ต ด่านศุลกากรท่าอากาศยานภูเก็ต ด่านศุลกากรกระบี่ ด่านศุลกากรสิชล ด่านศุลกากรนครศรีธรรมราช ด่านศุลกากรกันตรัง ด่านศุลกากรบ้านดอน และด่านศุลกากรสมุย